Prvé kolo bolo na programe v sobotu a to druhé o deň neskôr. Na sobotu bola v rámci 1. kola naplánovaná aj repríza finále uplynulého ročníka, ale šláger VK MIRAD PU Prešov – VKP Bystrina SPU Nitra sa pre povinnosti majstrovskej Nitry v MEVZA Cupe uskutoční v až v stredu 19. októbra.
V extralige mužov bude rovnako ako v minulej sezóne štartovať deväť tímov: VKP Bystrina SPU Nitra, VK Mirad PU Prešov, VK KDS-šport Košice, VK Spartak UJSKomárno, VO TJ Spartak Myjava, VK Prievidza, TJ Slávia Svidník, COP Trenčín a VKM Stará Ľubovňa. Účasť v extralige si v prelínacej súťaži vybojoval aj MVK Lokomotíva Zvolen, ale do najvyššej súťaže sa neprihlásil. V 1. časti súťaže sa tímy stretnú každý s každým doma a vonku a celkovo sa od 15. októbra do 17. decembra uskutoční 18 kôl. Celkovo sa odohrá až osem dvojkolových víkendov. Potom sa tímy rozdelia na dve skupiny 1.-5. a 6.-9 podľa umiestnenia po prvej časti súťaže. V 2. časti sa tímy opäť stretnú každý s každým doma a vonku.
Zápasy v skupine 1.-5. sa začínajú 7. januára, v skupine 6.-9. je prvé kolo na programe 14. januára.Posledné kolo druhej časti je naplánované na 4. marca a potom sa začne play off, kam postúpi osem najlepších tímov. Vo štvrťfinále, ktoré sa začína 11. marca, na seba narazia 1. – 8., 2. – 7., 3. – 6. a 4. – 5. a bude sa hrať na dve víťazné stretnutia. V semifinále sa bude hrať na tri víťazné zápasy, rovnako aj séria o 3. miesto a vo finálovej sérii sa tak ako po minulé roky popasujú tímy na štyri víťazné duely. Nového majstra spozná verejnosť najneskôr 3. mája 2017. Z extraligy nezostúpi po dlhodobej časti priamo nikto. Mužstvo na 9. mieste po nadstavbovej časti odohrá prelínaciu súťaž o účasť v extralige 2017/18 s prvými dvoma tímami I. ligy.
K hlavným favoritom na zisk titulu patrí obhajca z Nitry, vicemajster z Prešova a veľké ambície budú mať bronzové Košice, či legionármi a slovenskými reprezentantmi posilnené tímy Komárna a Prievidze. Medzi sezónami prišlo k trom trénerským zmenám. Pôsobisko po siedmich rokoch zmenil Ľuboslav Šalata, ktorý v predminulom ročníku doviedol Prešov k titulu a v minulom k triumfu v Slovenskom pohári. Šalata sa stal trénerom Myjavy, kde nahradil Martina Pipu. Prešov od novej sezóny povedie skúsený kouč Jaroslav Vlk, ktorý na Šariši už trénoval a v roku 2005 priviedol prešovský tím k prvého extraligovému titulu. Na Slovensko sa po angažmán v Kazachstane vrátil aj bývalý reprezentačný kormidelník Peter Kalný, ktorý bude viesť mladíkov z centralizovanej prípravy COP Trenčín. Kalný okrem Trenčína povedie aj reprezentáciu kadetov.
